1979年,萨达姆出任伊拉克总统兼任武装部队总司令、复兴党地区领导机构总书记。他大权在握,涤荡一切异己势力。一段纪录片记录了他在党内一次令人齿冷的清洗行动。他宣布在他们当中有叛徒,就在他坐在台上抽着烟斗之际,党员们歇斯底里地呼喊着支持他,而另外一些人则被带走处决。
1980年,他攻打伊朗,并与之交战达8年之久。1990年,他再次出击,入侵科威特。使用化学武器杀死数千名平民,镇压什叶派穆斯林和库尔德人发动的暴动等。
萨达姆的行动引起国际社会强烈不满。2003年3月20日伊拉克战争不可避免地爆发了,7月22日,两个儿子在枪战中被美军击毙。萨达姆逃藏数月后,于当年12月14日在其家乡提克里特被捕,从此开始了阶下囚的生活。