皮诺切特被迫于1990年交出总统宝座，稍后又交出兵权。从交出兵权的那一刻起，皮诺切特的不自在生活就开始了。
年近九旬接到传票
从他卸任后的许多年间，皮诺切特对所有的指控一概推为“下面人干的”，从而不承认其政治迫害。
然而，2004年，89岁的皮诺切特接到了指控他“侵犯人权”的传票。２００５年３月，皮诺切特执政时期的秘密警察部门负责人向智利最高法院提交了一份名单，上面列出了皮氏执政期间５００多个被捕后失踪的人员名单，成为他侵犯人权指控的最有力证据。
数度软禁家如牢房
皮诺切特接到传票并不意外，因为自从他下台之后，他过去的所做所为如同幽灵一般挥之不去。
1998年，皮诺切特前往伦敦做背部手术，西班牙一名法官发出逮捕令，要对他进行侵犯人权审判，皮诺切特因此被软禁在伦敦寓所中。但英国政府最终以“病重不宜”为由，于2000年3月放他回国。
回国后，关于皮诺切特在执政时期组织绑架、谋杀等一系列刑事指控便接踵而至，不过他因健康原因躲过了多桩官司。
虽说一直无法将皮诺切特送上审判席，但受害者和受害者的家属却数度迫使政府将皮诺切特软禁家中。晚年的皮诺切特其实跟坐牢没有什么两样。
风烛残年行尸走肉
皮诺切特的许多密友透露，自打他正式退位之后，他失去了对政治的所有兴趣，甚至不关注新闻。即便在家庭聚会时，他也常常一语不发，一脸的疲倦与木然。
不过，皮诺切特始终拒绝就执政期间发生的事件承担责任。直到今年１１月２５日度过自己９１岁生日时，皮诺切特才通过妻子宣读一份声明，表示愿意承担在执政１７年中所发生事件的政治责任。不过，他还为自己辩护，声称１９７３年的军事政变的唯一目的是“使智利变得强大起来，避免走向分裂”。
皮诺切特的女儿露西亚说，他的父亲为执政期间的众多受害者“感到难过”，但是不准备公开请求他们的原谅。
